Papel de la colonización por clones de alto riesgo en la transmisión e infección por Enterococcus faecium

Résumé

Enterococcus faecium ha emergido como una de las principales causas de infección nosocomial, principalmente por la diseminación de una subpoblación genética adaptada al hospital con resistencia a antibióticos, incluyendo ampicilina, levofloxacino y vancomicina. El aumento del número de bacteriemias nosocomiales por este microorganismo, principalmente en pacientes inmunodeprimidos, como los oncohematológicos, es preocupante y se ha asociado, entre otros factores, a la profilaxis con quinolonas. La colonización intestinal previa y el sobrecrecimiento de E. faecium son factores esenciales para su diseminación e infección. El objetivo principal de esta tesis fue estudiar la dinámica de colonización y transmisión nosocomial de E. faecium con resistencia a ampicilina y o vancomicina, e investigar las características inherentes a este microorganismo que favorecen la colonización, la infección y su transmisión. En el primer capítulo de esta Tesis describimos la colonización por E. faecium resistente a ampicilina en dos tercios de los pacientes oncohematológicos que recibieron profilaxis con levofloxacino, principalmente tras su suspensión. La colonización por E. faecium resistente a ampicilina tras la profilaxis, se asoció significativamente con la fase de la quimioterapia, la mucositis y la duración de la neutropenia. Se observó una diversidad clonal muy baja que disminuyó durante el ingreso y el predominio del clon persistente EfmRAST117B, con resistencia a levofloxacino, eritromicina y alto nivel de resistencia a estreptomicina, responsable de todos los episodios de bacteriemia detectados. Además, presentó los factores Esp, Acm, produjo bacteriocinas frente a la práctica totalidad de clones y metabolizó sustratos poco frecuentes como los polioles. También se documentó y caracterizó la emergencia de resistencia a linezolid en aislados de colonización. En los pacientes colonizados por E. faecium resistente a ampicilina se observó un incremento en las poblaciones de enterocos, principalmente E. faecium, con respecto al estado basal y en todos los pacientes se produjo además una reducción de la carga bacteriana total tras la administración de quimioterapia. La técnica PhP demostró una buena concordancia con el PFGE para la tipificación de E. faecium cuando se empleó un índice de similitud de 0,9. En el segundo capítulo se evaluaron la adhesión e invasión en aislados de E. faecium y S. gallolyticus de diferente origen a las células epiteliales intestinales y su capacidad de translocar a través de las mismas. Además, se estudió su capacidad de formar biopelículas sobre distintos soportes. Se observó que la capacidad de adhesión e invasión del epitelio intestinal fue baja para ambas especies, pero algo mayor los aislados de E. faecium. El único aislado de S. gallolyticus de origen animal, Sg78, mostró una elevada capacidad de invasión. S. gallolyticus, formó biopelículas sobre superficies con colágeno significativamente más que E. faecium. Por el contrario, los aislados de E. faecium demostraron una capacidad de translocación intrínseca muy superior a S. gallolyticus, aunque con diferencias importantes intra-especie. Los aislados de bacteriemia y de colonización de pacientes oncohematológicos, Efm106ST18 y Efm121ST117, demostraron ser los más eficientes translocando. En el tercer capítulo se describió la presencia de un brote oculto de enterococos resistentes a vancomcina en nuestro hospital y se demostró que en todos los aislados de muestras de colonización e infección, menos uno, la resistencia a vancomicina estaba codificada en el transposón Tn1546 y se debía a la presencia del genotipo vanA. Se detectó la presencia de un clon mayoritario EVRST17 y cuatro minoritarios, diseminado principalmente en los servicios de medicina interna y nefrología. El estudio de la transmisión dedo-dedo de dos cepas de E. faecium sensibles a vancomicina, E. faecium L50ST178 y E. faecium ST117 permitió establecer diferencias interindividuales importantes.