Estrategias computacionales para el estudio de la inhibición de la tracriptasa inversa del Virus de Inmunodeficiencia Humana

Resumen

El uso de distintas estrategias computacionales sobre la transcriptasa inversa (TI) del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 (VIH-1) ha llevado a determinar que: . TSAO-m3T, un inhibidor no nucleosídico (INN), se une de un modo novedoso en la interfaz de dimerización entre las subunidades p66 y p51 de la TI del VIH-1 distinto al sitio de unión de los INN "clásicos". TSAO-T es pues el primer ejemplo de molécula no peptídica que puede interferir en el proceso de dimerización de esta enzima, lo cual sugiere que podría ser utilizado como cabeza de ser de una nueva familia de inhibidores. . mediante un análisis quimiométrico tipo "COMBINE" aplicado a una serie de INN arilsulfonilbenzonitrilos de la TI del VIH-1 es posible derivar un modelo QSAR que no solo presenta un alta capacidad predictiva sino que también identifica correctamente los efectos de mutaciones obre residuos relevantes de la proteína que confieren tanto aumento de sensibilidad como resistencia. . en la enzima mutante Lys 103 Ans se confirma la existencia de una barrera de energía más alta para la creación del bolsillo de unión de los INN de la TI del VIH-1 que en la enzima silvestre, la cual se ha puesto de manifiesto mediante un método de simulación de dinámica molecular dirigida. . el efecto de la mutación Lys103 Asn se puede superar diseñando ligados, como la etravirina, que sean capaces de interferir con el enlace de hidrógeno establecido entre Asn103 ¿ Tyr 188 durante el proceso de acceso al sitio de unión, como se ha observado mediante la simulación de la entrada de distintos INN hasta el interior del bolsillo.