Caracterizacion molecular de Tuber melanosporum y otros ascomycetes hipogeos mediante análisis de fragmentos ARISA-TRFLP

Abstract

En el presente trabajo se abordó la caracterización molecular de Tuber melanosporum y otros ascomycetes hipogeos mediante ARISA-TRFLP. Para ello se desarrolló un sistema de detección universal basado en el análisis de fragmentos ITS completos (ARISA) o digeridos previamente con enzimas de restricción (TRFLP). Este sistema fue aplicado con éxito para la certificación de plantas de Q. ilex inoculadas con diferentes especies de interés comercial como T. melanosporum, T. indicum y T. borchii. La optimización del análisis TRFLP fue llevada a cabo mediante la comparación de la diversidad generada in silico por diferentes enzimas de restricción, seleccionándose finalmente un grupo de 3 enzimas, MaeII, BfaI y BstNI como las más adecuadas para la caracterización de comunidades de hongos superiores. Para responder a la cuestión de si este tipo de análisis puede ser llevado a cabo en cualquier grupo de ascomycetes hipogeos, se compararon los conceptos de especie linneano y cladístico en géneros como Tuber, Choiromyces o Picoa. El resultado fue que ambos conceptos coinciden en la mayor parte de los grupos, o coincidirían tras la adecuada revisión taxonómica de los mismos que evite sinonimias y especies crípticas. Sin embargo, se reconoce la existencia de grupos taxonómicos (p. ej. Picoa) cuya estructura genética hace difícil su caracterización molecular mediante análisis de fragmentos